因受“垃圾围城”困扰，我国正大力发展公私合营（PPP）垃圾焚烧发电项目。为使相应的政府补贴计算更加准确、调整更加合理，项目发展更加健康，围绕政府补贴计算方法开展相关研究。首先，通过对政府、社会资本和公众等各项目决策主体和决策层级不同利益目标的识别，采用双层规划法（BLPP）建立了政府补贴静态初始定价模型。然后，考虑多因素对项目运营的动态影响，利用系统动力学（SD）构建了政府补贴动态运营调整模型。最后，静态初始定价与动态运营调整模型两者协同建立形成SD-BLPP政府补贴模型。在此基础上，采用H市PPP垃圾焚烧发电项目的实例数据，运用Vensim软件验证了模型的有效性；并通过调整SD-BLPP模型参数，模拟运营环境变化，分析项目效益的波动情况，给出政府补贴调整建议。结果表明，SD-BLPP模型计算出的补贴单价合理，能够优化项目效益结构，可以实现运营条件变化时的项目效益预测和政府补贴动态调整，具有较好的有效性和适用性，为PPP垃圾焚烧发电项目政府补贴提供计算方法和调整建议提供了依据。