在人类活动的影响下,阿克苏河下游绿洲呈现出气候变化特征的差异。其中,阿克苏市夏季气温以0.20℃/10 a的速率在升高,而阿拉尔由于受绿洲效应的影响,夏季气温却以-0.27℃/10 a的速率呈下降趋势。人类干预已经成为阿克苏绿洲水资源变化的主导因素。为农业开发修建的拦河闸引水、水库蓄水等已改变了河道径流的年内变化,与中游西大桥水文站相比,位于下游的阿拉尔水文站夏季径流比重上升,春季下降。尽管近50年来天然来水量在不断增加,但由于垦植面积的扩大和粗放型农业的发畏,使灌溉引水和人类活动耗水不断增加,从而导致阿克苏河补给塔里木河的水量明显减少,阿拉尔水文站年径流量持续减少,径流量减少达17.64%。阿克苏河西大桥站水质在各时期均为Ⅰ级清洁水质,塔里木河阿拉尔的水质在绿洲农业大规模开发之前,河水未受到人为干扰,水质良好;而经过绿洲耕地开发和垦植洗盐,河水矿化度不断增加,阿拉尔站河水枯水期矿化度由1960年的0.67 g/L增加到2000年的5.27 g/L。人类活动改变了地表水的地域分配,从而影响到地下水的补给,使地下水的水位和水质发生盐化。大量引用河水漫灌,导致阿克苏河绿洲地下水位抬升,地表蒸发强烈,造成盐分积累,土壤次生盐渍化严重。