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蚋是一类吸血传病的医学昆虫，其分类区系研究是进行媒介鉴别和蚋媒病防治的基础性工作。蚋类在形态上具有高度相似性，难以用形态学方法进行鉴定，导致目前蚋类系统发育研究基础仍较为薄弱。近年来，分子生物学的迅速发展，为蚋种类鉴定和系统发育研究提供了新的方法。综述了截止2015年1月1日在NCBI网站上提交的所有蚋科昆虫的序列信息，对蚋的分子研究进行介绍和评述，并结合我国蚋的现状以及世界各地蚋的研究情况进行了讨论与展望。