滇白前种子转录组测序及功能注释

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【摘要】

：

采用高通量测序技术平台Illumina Novaseq 6000对滇白前种子进行转录组测序,共获得平均长度为753.9 bp的43663个Unigenes。注释到六大功能数据库(NR,COG,Pfam,Swiss-Prot,GO,

【作者】

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王建秋王晓丽曹子林

【机构】

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西南林业大学

【出处】

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种子

【发表日期】

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2021年3期

【关键词】

：

滇白前种子转录组测序基因功能注释 Silene viscidula Franch seed transcriptome sequencing gene

【基金项目】

：

云南省教育厅科学研究基金项目(2021 J 0162),云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目(5000511311),西南林业大学科研预研基金(18200115)

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采用高通量测序技术平台Illumina Novaseq 6000对滇白前种子进行转录组测序,共获得平均长度为753.9 bp的43663个Unigenes。注释到六大功能数据库(NR,COG,Pfam,Swiss-Prot,GO,KEGG)上的Unigene总数为29177个。滇白前Unigenes比对到NR数据库共有26688条,与甜菜、藜麦、栓皮栎、菠菜有较高同源性;25657条Unigenes在COG数据库得到26500个注释,分为23类;19942条Unigenes在GO数据库得到79481个注释

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