论文部分内容阅读
目的
对北京市一起手足口病聚集疫情进行病原学鉴定，明确其来源及基因组进化特征。
方法收集7份患者咽拭子样本，用荧光定量RT-PCR方法鉴定病原血清型。用RT-PCR扩增VP1片段并构建进化树，用于判断基因分型。RT-PCR扩增全基因组序列，计算各基因片段与参考株相似性，分析其基因重组及分子进化特征。
结果该起手足口病聚集疫情由B5亚型人肠道病毒A组71型（human enterovirus 71，EV-A71）引起。全基因组序列比对结果显示，各段基因均与B5亚型EV-A71参考株具有最高的相似性。基因重组分析结果表明，B5亚型EV-A71在进化过程中不断与A组肠道病毒在5’UTR区、P2区和P3区发生基因重组。
结论应密切监测输入性手足口病病例，关注EV-A71基因变异特征，评估现有疫苗对输入病毒的保护效力。