沙田柚RING-H2 finger基因的生物信息学分析

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为探讨沙田柚自交不亲和性的机理,利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚RING—H2finger基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:该基因全长为845bp,开放阅读框(ORF)全长为387bp,编码128个氨基酸,编码蛋白质的分子量为13.61KDa,理论等电点为4.26;该蛋白质含有一个植物RING-H2finger蛋白家族的保守结构域,为疏水性不稳定蛋白。氨基酸序列
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