【摘 要】
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目的:分析所有miR-223基因家族成员的序列特征,并对miR-223靶基因进行预测,然后分析miR-223靶基因的生物学功能。方法:利用Clustal X 1.83软件分析miR-223基因序列特征,MEGA
【机 构】
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川北医学院附属医院1.检验科,风湿免疫科,医学研究中心
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目的:分析所有miR-223基因家族成员的序列特征,并对miR-223靶基因进行预测,然后分析miR-223靶基因的生物学功能。方法:利用Clustal X 1.83软件分析miR-223基因序列特征,MEGA 5.0软件分析进化关系,再运用TargetScan、PicTar和miRDB进行靶基因预测,最后GO和KEGG进行功能分析。结果:在miRBase数据中获得miRNA-223基因家族成员的序列27条,绝大部分位于基因间隔区,少数成员的基因位置未知。大部分定位于X染色体,部分成员位于常染色体。miRNA-223成熟序列长度在20-23nt之间,同源性较高。系统进化树分析表明,miRNA-223基因家族成员分为三支。预测获得人类miRNA-223的可能具有27个靶基因,它们主要与信号转导、转录调控以及细胞生长发育等密切相关。结论:本研究结果不仅有利于理解miR-223基因家族的生物学功能,也可为后续研究提供理论依据。
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