【摘 要】
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目的基于生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后价值。方法对三个数据集(GSE118370、GSE32863、TCGA-LUAD)分别使用limma和edgeR包筛选出肺腺癌差异表达基因,对共同差异
【机 构】
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浙江大学医学院附属邵逸夫医院药学部,浙江大学医学院附属邵逸夫医院超声科
【基金项目】
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浙江省自然科学基金/药学会联合基金(编号:LYY18H310004)
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目的基于生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后价值。方法对三个数据集(GSE118370、GSE32863、TCGA-LUAD)分别使用limma和edgeR包筛选出肺腺癌差异表达基因,对共同差异基因进行功能富集分析,通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape进行可视化分析并用其插件cytoHubba来筛选关键基因,采用Kaplan-Meier曲线进行总体生存分析。结果共224个共同差异基因,其中上调基因34个,下调基因190个。共同差异基因在血管生成、白细胞
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