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当每一个体有相同的子个体，并且每一子个体的处理水平是成对的时候，我们使用套重复测量模型．令Yi=(Yilll，…，Yimrc)’是第i个个体的观测向量．假设Yi为相互独立的正态分布，均值为μi，协方差阵为∑>0．假设可简化为所有测量值的方差为σ^2；相同个体的不同子个体之间的成对测量值之间的关系如下：(1)不同列不同行的观测值；(2)相同列不同行的测量值；(3)相同行不同列的测量值，它们的协方差分别为ρ2σ^2，ρ3σ^2，ρ4σ^2．我们假设试验是给定的，用坐标自由(coordinate-free