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中草药青蒿，学名黄花蒿（Artemisia annua L．），属于中国独有的抗疟药用植物资源之一。根据蒿属植物rDNA ITS序列多态性设计TaqMan探针及引物，通过实时荧光PCR方法对黄花蒿进行检测。结果表明：该组探针-引物对黄花蒿有很强的特异性，除黄花蒿外，其余8种对照蒿属材料均未检测到荧光信号。该方法快速、简便、安全、准确，适用于黄花蒿的出入境检验。