【摘 要】
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为利用微卫星分子标记技术研究姜荷花品种的遗传多样性和分子调控机制,本研究以前期高通量测序结果为基础,用MISA软件发掘和分析了所获得的转录组数据的SSR位点,为后续研究提
【机 构】
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浙江省农科院花卉研究中心,浙江省萧山棉麻研究所
【基金项目】
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2017杭州市科技计划引导项目(20171226Y101);农业部创意农业重点实验室基金项目共同资助
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为利用微卫星分子标记技术研究姜荷花品种的遗传多样性和分子调控机制,本研究以前期高通量测序结果为基础,用MISA软件发掘和分析了所获得的转录组数据的SSR位点,为后续研究提供重要的基础。获得的19 902个SSR位点存在于15 891条序列中。获得的unigene数为64 471条,共132 833 884 bp,平均每2.06 kb出现一个SSR,出现多个SSR的序列有3 155个。姜荷花‘清迈粉’转录组微卫星中存在97种重复基元,其中（A/T）n占比例最高,约占43.6%;其中单核苷酸和三核苷酸重复相对
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