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MBL2与MASPs家族蛋白质相互作用的生物信息学分析

来源 :海南医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：cnsafety

【摘 要】

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目的:通过生物信息学方法对甘露糖结合凝集素2(MBL2)蛋白与甘露聚糖结合凝集素相关丝氨酸蛋白酶(MASPs)家族蛋白质的相互作用进行全面预测分析。方法:使用同源建模(Swiss-mod

【作 者】

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程少文  陈扬平  张安强  彭磊  梁华平  吕传柱 

【机 构】

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海南医学院第一附属医院创伤中心,急救与创伤研究教育部重点实验室,陆军军医大学大坪医院野战外科研究所,海南医学院急诊创伤学院

【出 处】

：

海南医学院学报

【发表日期】

：

2019年15期

【关键词】

：

甘露糖结合凝集素2 丝氨酸蛋白酶 生物信息学 

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81860347);海南省自然科学基金(818MS140);海南省科协青年科技英才创新计划项目(QCXM201816);海南省卫生计生行业科研项目(18A200178);军事医学创新工程专项(18CXZ002)

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目的:通过生物信息学方法对甘露糖结合凝集素2(MBL2)蛋白与甘露聚糖结合凝集素相关丝氨酸蛋白酶(MASPs)家族蛋白质的相互作用进行全面预测分析。方法:使用同源建模(Swiss-model)和折叠识别(Phyre2)分别来构建MBL2蛋白与MASPs家族蛋白质的结构,使用STRING数据库及ZDOCK3.02预测分析MBL2与MASP1、MASP2两个蛋白质的相互作用情况。结果: MBL2与MASP1和MASP2均存在直接相互作用,并且和COLEC11、COLEC10、FCN2、C4B等构成相互作用网络

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