目的检测原发性肝癌(hepatocellular carcinomas,HCC)中人RUNT相关转录因子3(human runt-related tran-scription factor 3,RUNX3)基因启动子的甲基化情况,探讨其与患者临床特征的关系。方法收集95例HCC患者的肿瘤标本及相应的癌旁肝组织、20例正常肝组织,95例HCC患者中合并肝硬化患者57例,按照肝硬化Child-Pugh肝功能分级标准,将57例患者分为A级36例,B级11例,C级10例,运用甲基化特异性PCR检测RUNX3基因启动子CpG岛甲基化状态,分析RUNX3甲基化情况与患者临床特征的关系。结果 95例HCC组织中,45.3%(43/95)存在RUNX3基因CpG岛的异常甲基化,癌旁肝组织中有9.5%(9/95)存在异常甲基化,而正常肝组织中未检测到RUNX3基因CpG岛的异常甲基化;RUNX3基因异常甲基化在HCC组织中的发生率与癌旁组织及正常肝组织比较差异有统计学意义(P<0.01),RUNX3基因CpG岛甲基化与患者肝硬化、门脉癌栓关系密切(P<0.05)。肝硬化Child-Pugh肝功能C级组RUNX3启动子甲基化水平明显高于A级组和B级组(P<0.05)。结论 HCC存在RUNX3基因CpG岛异常甲基化,CpG岛的甲基化可能是导致其基因表达降低的主要原因之一,并与患者肝硬化、门脉癌栓密切相关。