芥蓝miR172家族成员进化特性比较及时空表达分析

来源 :西北植物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lc813

【摘要】

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为了明确植物miR172家族成员的进化特性及其在不同组织部位的表达情况,该研究以芥蓝miR172a家族为例,通过芥蓝miR172a成熟体序列比对、前体(pre-miRNA)二级结构预测、系统发

【作者】

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李文静王杏茹刘涛陈冰星赖钟雄郭容芳

【机构】

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福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建农林大学园艺学院

【出处】

：

西北植物学报

【发表日期】

：

2018年8期

【关键词】

：

芥蓝 miR172a miR172a前体进化特性 Chinese kale miR172a pre-miR172a evolutionary characte

【基金项目】

：

国家自然科学基金(31401859,31772310),博士后第10批特别资助(2017T100464),福建省重大专项(2015NZ0002-1)

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为了明确植物miR172家族成员的进化特性及其在不同组织部位的表达情况,该研究以芥蓝miR172a家族为例,通过芥蓝miR172a成熟体序列比对、前体(pre-miRNA)二级结构预测、系统发育进化树构建、靶基因预测及实时荧光定量等手段,对芥蓝miR172a和miR172b基因家族的进化特性及其在芥蓝不同组织部位中的表达规律进行分析。结果显示:(1)芥蓝miR172家族存在20个成熟体成员,通过比对发现20条序列都存在一个重叠区域,该区域中ACTAGATC 8个碱基高度保守,并且在芥蓝pre-miR172

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