德汉劳绵蟹(Lauridromia dehaani)线粒体基因组测定及短尾下目系统发生分析

来源 :南京师大学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zmyz

【摘要】

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本研究使用高通量测序方法首次获得德汉劳绵蟹(Lauridromia dehaani)的线粒体基因组全序列,确定其线粒体基因组是一个环状DNA,全长15,755 bp,包含37条基因.通过分析比较德汉

【作者】

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邢雨辉周豪邹永梅姚文佳张晨岭印学晨邹修文陈建琴

【机构】

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南京师范大学中北学院,江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,南京师范大学生命科学学院

【出处】

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南京师大学报:自然科学版

【发表日期】

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2021年1期

【关键词】

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德汉劳绵蟹线粒体基因组肢孔派绵蟹总科 Lauridromia dehaani mitochondrial genome Podotremata Dromi

【基金项目】

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江苏省自然科学基金项目(BK20171406),江苏省高等学校自然科学基金项目(16KJA180005,16KJB180006).

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本研究使用高通量测序方法首次获得德汉劳绵蟹(Lauridromia dehaani)的线粒体基因组全序列,确定其线粒体基因组是一个环状DNA,全长15,755 bp,包含37条基因.通过分析比较德汉劳绵蟹线粒体基因组的tRNA二级结构、蛋白编码基因的碱基组成、起始/终止密码子和选择压力,发现trnS 1缺失DHU臂,这种现象在短尾类线粒体基因组中比较常见;不同功能的蛋白编码基因的碱基组成和选择压力不同;cox 1以不常见的ACG作为起始密码子;在多个基因重排断裂点处有长达32 bp以上的间隔序列(最长达1

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