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利用结构基因座和微卫星标记分析了中国蒙系绵羊4个品种间的基因流动情况。结果显示，由结构基因座得出的遗传分化系数在0．0164～0．0455之间，由微卫星位点得出的遗传分化系数在0．0107—0．0239之间，说明遗传变异绝大部分存在于品种内，蒙系绵羊品种间的遗传分化水平很低。结构基因座（Nm=7．971）和微卫星位点（Nm=15．732）都反映出品种间的基因流通畅。品种间的遗传差异与地理距离之间无直接相关关系。初步推断我国蒙系绵羊品种间的遗传分化主要是自然选择（生境异质性）作用的结果。