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首都医科大学普通外科学系以首都医科大学宣武医院为牵头单位，以首都医科大学附属北京友谊医院、北京朝阳医院、北京同仁医院、北京天坛医院、北京安贞医院、复兴医院、北京佑安医院等8所医院的普通外科为主体组建而成。普通外科学系整合了首都医科大学各附属医院普通外科的学科资源，体现了各医院的特色，实现了优势互补，提高了学科发展的质量和速度，推进了人才培养和学科建设。普通外科学系是中华医学会外科学分会门静脉高压症学组、腹腔镜内镜学组、胰腺学组、结直肠肛门疾病等专业学组的组长／副组长单位。学系主任为孙家邦教授，副主任为王宇