目的建立限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)方法分析结核分枝杆菌DNA指纹并探讨其分子流行病学特点及与药物敏感性的关系.方法提取结核分枝杆菌DNA,经内切酶PvuⅡ酶切、琼脂糖凝胶电泳、Southern转印后,与地高辛标记的IS6110探针杂交,以酶免疫试验检测信号,比较各临床分离株IS6110指纹.结果根据IS6110指纹特征的同源性的高低,将所检测的127株结核分枝杆菌分为A、B、C和D 4簇,4簇的株数(比例)分别为50(39.4%)、12(9.4%)、16(12.6%)和49(38.6%).各簇菌株的IS6110指纹特征:A簇菌株间相似系数在70%以上,共同拥有1.3kb、1.9kb、2.1kb、2.7kb、3.3kb、4.5kb、5.0kb、6.5kb等位置的条带;B簇菌株间相似系数也在70%以上,与A簇菌株族间相似系数较高,为65%,与A簇相比,1.9kb以上条带与A簇相似,但缺乏1.9kb以下的条带;C簇带型分布散且较为平均,在1.3kb、2.2kb、3.3kb、5.5kb等位置都有共同拥有的片段;D簇菌株条带数目少,呈现高度多态性,所有菌株之间没有相同位置的条带,相互间同源性较低.其中A、B、C 3簇相似系数在55%以上,且有相同位置的片段,将它们称为"成簇菌株".元共同条带的D簇称为"不成簇菌株".30岁以上人群"不成簇菌株"所占比重高于30岁以下人群,低年龄组"成簇菌株"比例高,近期传播结核较为严重.检测菌株的多态性变化在结核分枝杆菌耐药与敏感株中的分布,A族菌株的耐药比例低于其它3簇菌株.未发现结核分枝杆菌DNA指纹特征与居住状况和职业之间的联系,也没有发现传播频率在男女性别之间存在差异.结论深圳地区菌株基因型与北京地区菌株相似.深圳地区低年龄组(30岁以下)的结核病传播以近期传播为主.与北京地区相似菌株耐药比例低于其它型菌株.
结核分枝杆菌DNA指纹技术研究及其应用
【摘 要】
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目的建立限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)方法分析结核分枝杆菌DNA指纹并探讨其分子流行病学特点及与药物敏感性的关系.方法提取结核分枝杆菌DNA,经内切酶PvuⅡ酶切、琼脂糖凝胶电泳、Southern转印后,与地高辛标记的IS6110探针杂交,以酶免疫试验检测信号,比较各临床分离株IS6110指纹.结果根据IS6110指纹特征的同源性的高低,将所检测的127株结核分枝杆菌分为A、B、C和D 4
【机 构】
:
深圳市慢性病防治院;中山大学生命科学院,中山大学生命科学院,深圳市慢性病防治院,
【出 处】
:
中华微生物学和免疫学杂志
【发表日期】
:
2003年23期
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