评价变性高效液相色谱 (DHPLC) 技术筛查卵巢早衰转化生长因子β受体3 (TGFBR-3) 基因第11、12外显子多态性的临床应用价值。
方法选择2009年2月至2011年12月在南方医科大学附属深圳市妇幼保健院确诊的卵巢早衰患者110例为卵巢早衰组,以月经规则、性激素检查在正常范围内的年龄匹配的妇女110例为对照组。采用DHPLC技术筛查TGFBR-3基因第11、12外显子多态性,并以DNA测序结果为金标准,计算DHPLC技术筛查的灵敏度、特异度、假阴性率、假阳性率、Youden指数、阳性预测值和阴性预测值等指标。并随机抽取20%的样本 (22例),以相同的实验条件,进行第二次DHPLC技术筛查,与第1次结果进行比较,计算Kappa值。
结果TGFBR-3基因第11外显子未检测到多态性,而第12外显子有两个单核苷酸多态性。2022 T/C位点多态性:卵巢早衰组CC、TC、TT基因型频率分别为0.9% (1/110) 、22.7% (25/110) 、76.4% (84/ 110),C、T等位基因频率分别为12.3% (27/220) 、87.7% (193/220) ;对照组CC、TC、TT基因型频率分别为0、9.1% (10/110) 、90.9% (100/110),C、T等位基因频率分别为4.5% (10/220) 、95.5% (210/ 220) ;两组间各基因型频率及等位基因频率分别比较,差异均有统计学意义 (P均<0.05) 。2161-75 C/T多态性位点基因频率、等位基因频率卵巢早衰组和对照组比较,差异均无统计学意义 (P均>0.05) 。以DNA测序结果作为基因多态性判断金标准,DHPLC技术筛查结果的灵敏度为100%、特异度为97.9%、Youden指数97.9%、阳性预测值为96.3%、阴性预测值100%。两次DHPLC技术筛查结果Kappa值为0.888 (P<0.05) 。
结论DHPLC技术筛查TGFBR-3基因多态性具有较高的真实性、可靠性和实用性。