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石油系统建模通常使用1D、2D或者最好是3D地质模型来模拟石油生成、排出、运移和损耗的历史。一个常规含油气系统模式为,生成的石油从源岩排出,然后运移,直到它被圈闭在储层中,或从系统中损耗。在一个非传统的体系中,勘探目标往往是针对源岩中残留的油气,二者的主控地质过程是相同的,唯一不同的是,前者的目标是排出的油气,而后者的目标是残留的油气。