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目的：探讨胃及十二指肠溃疡的药物治疗方法，以及对其临床治疗效果进行分析，从而更好地指导临床用药。方法：选择2011年1月至2013年12月我院门诊及内科病房收治的68例胃及十二指肠溃疡患者作为研究对象，随机分成实验组和对照组，每组各34例患者，实验组患者给予奥美拉唑、甲硝唑以及阿莫西林治疗，对照组患者给予法莫替丁、甲硝唑以及阿莫西林治疗；观察两组患者的治疗效果。结果：通过研究可以发现，实验组患者的总有效率为91.18%，胃镜一年的复发率为11.8%；对照组患者的总有效率为76.47%，胃镜一年的复发率为32.4%，两组差异具有统计学意义（P＜0.05）。结论：临床上使用奥美拉唑、甲硝唑以及阿莫西林治疗胃及十二指肠溃疡效果较佳，不仅缩短溃疡的愈合时间，还可以提高治愈率，降低复发率，具有很好的安全性，值得临床上的推广和应用。