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以14个黑木耳[Auricularia auricula（L.ex Hook）Underw]菌株为试材,对黑木耳总DNA提取方法和ISSR-PCR扩增反应条件及引物进行了筛选。结果表明,改进的SDS抽提法可以在较短时间内提取到高纯度的DNA产物;并筛选出了可产生遗传多样性的15条引物,其中引物ISSR11、ISSR12、ISSR14扩增结果的稳定性好、多态性强。经凝胶电泳比较,引物ISSR14可作为黑木耳PCR–ISSR反应的适宜引物。