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阿拉塔格花岗岩分布于东天山加里东造山带内的弧后盆地蛇绿岩套中,地质剖面自下而上为超镁铁质岩、镁铁质岩、中性岩和斜长花岗岩。各岩相之间呈渐变过渡关系。岩石学、岩石化学和稀土元素特征以及与其它地区典型幔源型花岗岩特征的对比表明阿拉塔格花岗岩属于幔源型,它代表着弧后盆地蛇绿岩序列内部分异作用末期的产物。