【目的】分析广东省2009-2012年手足口病在三间分布和病原构成上的流行病学特征及其变化趋势。【方法】利用广东省2009-2012年手足口病监测数据、广东省人口数据和地理资料,对全省的手足口病时间趋势、人群分布特征以及病原构成等进行分析,继而运用Moran’s I确证相邻区县发病率的空间自相关性和异质性,并纳入贝叶斯空间模型,估算各年各区县发病的相对危险度(RR),探索全省手足口病发病风险变化的空间模式。【结果】广东省手足口病病例数(9.3万~33.1万)和发病率(9.75/万~32.08/万)逐年上升,年内呈双峰分布。男性高发,男女发病率之比(1.75~1.90)逐年下降;不同类型病例均主要集中于5岁以下儿童,以1~<2岁组儿童所占比例和发病率最高;EV71感染者的重症率(22.62%~34.11%)和病死率(0.93%~3.83%)均比COX A16感染者(重症率:1.32%~3.48%;病死率:0.00%)要高。各年Moran’s I在0.39~0.51之间。珠三角地区的发病率和相对危险度最高,且逐年上升。【结论】在2009-2012年之间,广东省手足口病流行强度逐年增强。不同时间、不同性别、不同年龄组发病率均存在较大差异。手足口病的发病率存在中等强度的空间自相关性和异质性,珠三角区域是该病高发病高风险区域,且每年的空间风险分布格局有所变化。