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肠杆菌中喹诺酮类抗菌药耐药大多是由染色体突变引起的，但也可能由含Qnr基因的质粒介导。Qnr蛋白保护DNA不受喹诺酮类药物的影响而降低敏感性，如萘啶酸。Qnr蛋白包括QnrA蛋白、QnrB蛋白和QnrS蛋白，在亚洲广泛存在于被克拉维酸抑制的超广谱β-内酰胺酶和质粒介导的头孢菌素酶的肠杆菌科中，并快速蔓延。QnrA基因包含在sul1型整合子中。近年来，在水生的海藻谢瓦纳拉菌中发现了与QnrA基因起源非常接近的基因，提示液体环境可能决定了QnrA基因在体内的转移场所。进一步分析这种基因转移的作用，可能对阻止这