基于PCR-DGGE与高通量测序技术的恩施地区腊鱼细菌多样性评价

来源 :现代食品科技 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zwfyazl

【摘要】

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作为我国传统的发酵食品,腊鱼因具有独特的滋味和口感而深受人们青睐。以16 s rDNA基因为标靶,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)与Mi Seq高通量测序技术相结合

【作者】

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王玉荣廖华赵慧君张振东郭壮

【机构】

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湖北文理学院食品科学技术学院,恩施市农业局,恩施市公共检验检测中心

【出处】

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现代食品科技

【发表日期】

：

2018年11期

【关键词】

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恩施腊鱼细菌变性梯度凝胶电泳高通量测序技术

【基金项目】

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国家自然科学基金青年科学基金项目(31501455)

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作为我国传统的发酵食品,腊鱼因具有独特的滋味和口感而深受人们青睐。以16 s rDNA基因为标靶,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)与Mi Seq高通量测序技术相结合的方法对采集自恩施地区腊鱼样品的细菌多样性进行了研究。PCR-DGGE结果表明,腊鱼样品中的细菌以Psychrobacter和Lactobacillus为主。Mi Seq高通量测序结果表明,腊鱼中的优势细菌门主要为变形菌门(Proteobacteria)、硬壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidet

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