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针对IEEE802.16eOFDMA系统中变长子载波数目的特点,提出了一种高速变长可配置FFT/IFFT的整体结构,并创新性的提出了一种基于流水线的蝶型单元分支结构.该设计可以满足IEEE802.16eOFDMA系统中所有FFT/IFFT变长点数的系统要求,并可方便的将其拓展到多种变长FFT/IFFT的具体应用场合.通过该结构设计出的FFT/IFFT模块已成功通过了StratixⅡ EP2S180FPGA的实际验证并顺利应用于IEEE802.16dOFDM系统的接收机原型中.