目的对2010年重庆彭水县一起人感染羊痘病毒疑似病例进行病原学检测,以明确诊断。方法对患者进行流行病学调查,采用羊痘病毒特异性引物对5例患者的5份疱疹液标本和来自3只病羊的眼分泌物、痘疱液、痘痂块共4份标本进行PCR检测,并采用VeroE6细胞进行病毒分离;对扩增出的DNA片断进行测序,经BLAST进行序列比对分析。结果报告的34个病例均与病羊有接触史。1份病羊痘疱液标本山羊痘病毒分离阳性。9份标本的羊痘病毒A29L基因的413bp片段扩增结果均为阳性。使用A95/B7扩增羊痘病毒P32基因,5份人的疱疹液标本中,4份为PCR扩增阳性。2份病例标本及1份病羊的病毒分离物P32基因扩增产物的DNA片段序列间具有100%的同源性,3条序列与山羊痘病毒G20-LKV病毒株具有99%的同源性。系统进化树显示:重庆市彭水县获得的山羊痘病毒与我国广西柳江2003年流行的病毒和越南2005年流行的毒株进化距离较近,与2009年重庆及甘肃的病毒株也有较近的进化距离。结论重庆市彭水县人感染羊痘病疫情系由人直接接触病羊而感染山羊痘病毒所致。