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达·芬奇以自己的细致准确的观察与形象的直觉推理的结合，将对人与自然界的本性与相互作用的思考带入形而上学的领域，完善了统一的宇宙整体观。这是达·芬奇艺术探索在内的全部事业的内在基础和核心动力。整体论观念在达·芬奇的探索中首先表现为许多事物的类比，微观世界与宏观世界的对应，万物同一的思想，还表现为世界是有机的，不仅仅是一些具有深层一致规律的事物的堆积和总和。另外，还有更为重要的东西——人体、地球、自然成为一个整体的缘由，即灵魂与力（力或能，是他总结出的宇宙中所有行为和现象的关键）