辣椒VQ基因家族的鉴定与低温胁迫下的表达分析

来源 :湖南中医药大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：vitaver

【摘要】

：

目的从辣椒(Capsicum annuum L.)全基因组中鉴定VQ基因,并进行基因结构、基因进化、染色体定位以及组织表达和低温诱导表达分析。方法利用辣椒基因组数据库,通过生物信息学方

【作者】

：

张亚利谢玲玲欧阳娴樊悦罗娟童巧珍刘峰

【机构】

：

湖南中医药大学药学院,湖南省农业科学院西瓜甜瓜研究所,湖南省农业科学院蔬菜研究所

【出处】

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湖南中医药大学学报

【发表日期】

：

2016年7期

【关键词】

：

辣椒 VQ基因家族鉴定低温胁迫表达分析

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目的从辣椒(Capsicum annuum L.)全基因组中鉴定VQ基因,并进行基因结构、基因进化、染色体定位以及组织表达和低温诱导表达分析。方法利用辣椒基因组数据库,通过生物信息学方法,鉴定辣椒基因(Ca VQ)家族成员;利用MEME、GSDS 2.0、DNAMAN8、Map Inspect等软件进行基因结构及染色体定位分析;采用MEGA6.0软件进行系统进化树分析;利用RNA-seq数据及q RT-PCR的方法进行辣椒组织表达模式和低温胁迫分析。结果辣椒全基因组中含有29个Ca VQ基因;Ca VQ基

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