测定重复序列的一种有效方法——定向删除法

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基因组中存在大量的重复序列,它们具有调节基因表达和染色体的生理代谢等重要的生物功能。重复序列由于其结构的特殊性,不但鸟枪法基因组测序不能有效地测定它们的序列,而且采用引物步移法等一般的定向测序方法也不能对其准确测定。本研究利用核酸外切酶Ⅲ定向删除技术,结合菌液电泳等快速筛选方法,对黄蜂蜘蛛三个高度重复序列丝蛋白基因MaSp2、CySpl和CySp2进行了准确的测定。研究结果表明核酸外切酶Ⅲ定向删除法是一种测定高度重复序列的有效方法,利用普通的琼脂糖电泳技术,该方法可以单向地有效测定重复序列的长度可达10k
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