【摘 要】
：
目的 对在广西中越边境口岸地区分离的乙型脑炎病毒株Jc19095zj的全基因组进行测定和分析,了解其结构及与其他毒株的进化关系和抗原变异情况.方法 采用PCR方法分段扩增Jc19095zj的全基因组并测序,利用Gen-estudio软件拼接毒株的全基因组序列,利用Mega Ⅹ软件构建全基因组和E基因的系统进化树,采用Bioedit 7.0软件比较核苷酸及氨基酸序列的差异性.结果 Jc19095zj基因组总长10965个核苷酸,共编码3432个氨基酸;系统进化树显示,Jc19095zj与广东GⅠb亚型毒株(
【机 构】
：
广西壮族自治区疾病预防控制中心,广西南宁530028;靖西市疾病预防控制中心
论文部分内容阅读
目的 对在广西中越边境口岸地区分离的乙型脑炎病毒株Jc19095zj的全基因组进行测定和分析,了解其结构及与其他毒株的进化关系和抗原变异情况.方法 采用PCR方法分段扩增Jc19095zj的全基因组并测序,利用Gen-estudio软件拼接毒株的全基因组序列,利用Mega Ⅹ软件构建全基因组和E基因的系统进化树,采用Bioedit 7.0软件比较核苷酸及氨基酸序列的差异性.结果 Jc19095zj基因组总长10965个核苷酸,共编码3432个氨基酸;系统进化树显示,Jc19095zj与广东GⅠb亚型毒株(MH184573)的亲缘关系较近,与越南株90VN70(1990年)处于同一大分支上,而广西本地毒株131V(2007年)在另一个不同的大分支上.E基因系统进化树显示,该毒株与4株近期引起疫情爆发的毒株在同一个分支上.比较全基因组核苷酸序列的同源性,Jc19095zj与进化树中23株JEV毒株的同源性为78.9％～99.1％,其中与GⅠb毒株的同源性为97.9％～99.1％.该毒株与疫苗株SA14-14-2核苷酸差异率为11.5％,氨基酸差异率为2.0％.进一步分析E蛋白的氨基酸位点,Jc19095zj和4株引起乙脑疫情爆发的JEV毒株均与疫苗株SA14-14-2之间存在14个共同的差异位点,但与引起乙脑疫情爆发的4个毒株之间不存在差异.结论 Jc19095zj属于GⅠb亚型,推测目前广西流行株JEV存在GⅠ和GⅢ两种基因型,其中GⅠ型为优势基因型,且决定Jc19095zj毒力和抗原性的关键位点未明显改变,因此疫苗株SA14-14-2理论上对该毒株引起的感染仍具有保护力.
其他文献
细菌生物被膜是指粘附在细胞或有机物质表面并被自身产生的胞外基质包裹所形成的聚合微生物群落,可以抵抗抗菌药物和宿主免疫系统的杀伤,是导致慢性感染的重要原因.本文对细菌生物被膜的形成与抗生物被膜感染药物研究进展进行综述,以期为临床的抗感染治疗提供参考.
目的 检测病毒性脑炎患儿脑脊液外泌体中微小RNA-221/222(miR-221/222)水平,并探讨miR-221、miR-222与病毒性脑炎发生及预后的关系.方法 选取2018年3月-2019年6月于本院住院治疗的79例病毒性脑炎患儿为病脑组,并根据预后评定将患儿分为预后良好组50例,预后不良组29例.选取同期68例以头痛为主诉而脑脊液正常患儿作为对照组.采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测脑脊液外泌体中miR-221、miR-222表达水平;分析病毒性脑炎患儿脑脊液外泌体中miR-221与
目的 分析和探讨感染性心内膜炎(infective endocarditis,IE)的前驱感染症状、病原菌分布特征以及影响感染性心内膜炎患者转归的独立危险因素.方法 2017年1月-2020年8月本院收治的感染性心内膜炎患者112例,根据患者转归情况分为存活组104例和死亡组8例.记录患者前驱感染症状及体征,并采用全自动微生物分析仪鉴定患者的血液标本中病原菌分布情况;收集患者的相关临床资料进行影响IE患者转归的单因素分析和多因素Logistic回归分析.结果 IE患者前驱症状主要为发热、胸闷,例数分别为1
目的 检测支气管哮喘急性发作患者外周血可溶性髓系细胞触发受体-1(sTREM-1)、簇分化抗原64(CD64)、肝素结合蛋白(HBP)表达水平,探讨sTREM-1、CD64、HBP对支气管哮喘合并呼吸道细菌感染的诊断价值.方法 选择2019年6月-2021年3月在本院呼吸科住院的支气管哮喘患者122例,经痰液培养检查确诊为合并细菌感染53例(称合并细菌感染组),合并病毒感染37例(称合并病毒感染组),单纯哮喘32例(称单纯哮喘组).采用ELISA法检测患者血清sTREM-1、HBP水平,采用流式细胞仪检测
目的 探讨不同通气方式对急性加重慢性阻塞性肺疾病(AECOPD)患者呼吸道病毒分布及预后的影响.方法 选取2018年10月-2020年10月本院收治的AECOPD患者194例,采用随机数字表法并按照1∶1的比例将其分为无创机械通气(NIV)组97例和有创机械通气(IMV)组97例.NIV组患者在常规治疗基础上使用飞利浦伟康Bi-PAP呼吸机面罩吸氧,IMV组患者在常规治疗基础上经气管内插管进行机械通气.收集两组患者临床资料进行比较分析;采用实时荧光定量PCR检测鼻咽拭子标本中甲型流感病毒(FLU-A)、乙
目的 分析阴道微生物菌群、宫颈局部免疫功能与宫颈上皮内瘤变(CIN)的相关性.方法 选择2018年6月-2020年6月本院收治的CIN患者102例为研究组.根据宫颈脱落细胞学检查及活检病理检查,CIN Ⅰ级36例,CINⅡ级45,CINⅢ级21例.随机选取同期于本院进行阴道分泌物检查的女性100例为对照组.收集入组对象阴道分泌物和宫颈组织标本,检测阴道菌群及宫颈局部T细胞亚群,利用受试者工作特征曲线评价阴道微生物菌群、宫颈局部免疫功能对CIN的预测价值,采用多因素Logistic回归分析影响CIN发生的危
目的 探讨输入性疟疾的临床观察与护理措施.方法 对山东省寄生虫病防治研究所2016年5月-2020年10月收治的210例输入性疟疾患者采用镜检疟原虫血涂片进行诊断,观察临床诊治过程中出现的寒战高热、乏力、纳差、肝脾肿大、黄疸、少尿或无尿、精神意识障碍、贫血和血小板减少等体征,比较青蒿素类药物蒿甲醚与青蒿琥酯的治疗效果,并采取多方面综合护理干预及综合预防.结果 输入性疟疾患者均有旅居国外生活史及蚊虫叮咬史.患者人院后完善各项检查后采集外周血涂片镜检疟原虫,通过及时调整治疗和护理方案后,疟疾患者得到有效治疗,
目的 检测胃癌组织中细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、生长分化因子11 (GDF11)表达情况,探讨二者与胃癌患者幽门螺旋杆菌(HP)感染的关系.方法 2018年1月-2020年5月在本院就诊并接受手术治疗的胃癌患者91例,手术过程中取胃癌组织与正常胃黏膜组织,采用免疫组织化学染色检测CDK2、GDF11蛋白水平,分析二者与胃癌临床病理特征的关系及与HP感染的相关性.结果 91例胃癌患者中,快速尿素酶试验检出HP阳性66例,Giem-sa染色检查HP阳性58例,合计检出HP感染75例.免疫组织化学染色
目的 探讨老年真菌性鼻窦炎(FRS)患者感染病原菌的分布特征,并分析其定植的高危因素.方法 2019年1月-2021年1月本院收治的老年真菌性鼻窦炎患者149例,所有患者均经直接显微镜检查和病原培养鉴定确诊.149例患者分为真菌定植组和非真菌定植组,分析病原菌菌群感染性别分布及标本取材部位分布情况.收集患者的年龄、性别、吸烟、饮酒、病程、侵入性操作、联合使用抗生素情况、抗生素更换次数、糖皮质激素使用时间、合并症、真菌菌种、发病部位、侵袭性等资料,分析影响老年FRS真菌定植的高危因素.结果 149例老年FR
目的 探究宫颈癌合并阴道炎患者病原菌感染情况及阴道局部辅助性T细胞17(Th17)的细胞免疫功能及血清因子变化.方法 选取2018年1月-2021年1月本院收治的152例新发宫颈癌患者,根据是否合并阴道炎分为阴道炎组(54例)和对照组(98例),比较两组患者阴道分泌物中病原菌检出情况、HPV感染情况,以及Th17细胞和细胞因子(IL-17,IL-10,TGF-β)水平.结果 阴道炎组检出阴道致病菌感染者37例(68.52％),对照组检出致病菌感染者46例(46.94％),两组比较差异有统计学意义(x 2-