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抗菌肽是一类具有杀菌作用的免疫活性物质，是动物非特异性免疫系统的重要组成部分。水生动物抗菌肽的种类丰富，生化组成和分子结构多样，具有重要的研究价值和应用前景。本文介绍了2大类主要的水生动物（甲壳类和鱼类）的抗菌肽的种类和结构特点、基因克隆和体外表达、分子文库建立以及转抗菌肽基因动物的研究进展，并展望了其作为新型绿色、安全、环保的饲料添加剂的应用前景。