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【目的】对寄生于柑橘与杉木2种寄主的柑橘半穿刺线虫种群的rDNA-ITS区（ITS1-5.8S-ITS2）及形态变异进行研究,分析种群间遗传多态性及其亲缘关系。【方法】对采自中国3个省份（福建、四川、贵州）柑橘产区的21个柑橘半穿刺线虫种群（柑橘种群）及福建省杉木林区的6个柑橘半穿刺线虫种群（杉木种群）的ITS区进行PCR扩增、克隆与测序,通过相关软件进行序列比对与系统发育分析;对3个柑橘种群及1个杉木种群进行形态特征测计分析。【结果】柑橘半穿刺线虫的柑橘种群与杉木种群相比,ITS1序列相似性为93.2%