幽门螺杆菌基因组表达谱芯片的研制

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【摘要】

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以H.priori 26695和J99作为模板，采用多聚酶链反应（PCR）扩增得到所需要的开放阅读框（open reading frame，ORF）片段。使用Genemachine点样仪进行点样，采用随机九聚体、Cy3-dCTP或Cy5-

【作者】

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韩跃华刘文忠史耀舟赵国屏萧树东张庆华

【机构】

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浙江大学医学院附属第二医院消化科,上海市消化疾病研究所上海交通大学医学院附属仁济医院,生物芯片上海国家工程研究中心

【出处】

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微生物学通报

【发表日期】

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2007年1期

【关键词】

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幽门螺杆菌基因组表达谱芯片 Helicobacter pylori Genome Expression microarray

【基金项目】

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上海市重点学科建设基金资助项目（No.Y0205）.

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以H.priori 26695和J99作为模板，采用多聚酶链反应（PCR）扩增得到所需要的开放阅读框（open reading frame，ORF）片段。使用Genemachine点样仪进行点样，采用随机九聚体、Cy3-dCTP或Cy5-dCTP和SuperscriptⅡ标记H.priori RNA标本，完成芯片杂交过程牧据判断标准是标化后Cy3／Cy5比值（ratio）≤0．5为基因表达上调，若ratio值≥2．0则为表达下调。采用芯片重复性、信噪比评估芯片质量，应用RT-PCR反应验证芯片结果。研制的

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