【摘 要】
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生物学通路被广泛应用于基因功能学研究,但现有的生物学通路知识并不完善,仍需进一步扩充.生物信息学预测为通路扩充提供了一种有效且经济的途径.文章提出了一种融合蛋白质-
【机 构】
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广东医学院医学系统生物学研究所与公共卫生学院,中山大学公共卫生学院,茂名市人民医院
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(编号:31071166,81373085);广东省科技计划攻关项目(编号:2009A030301004);东莞市科技重点项目(编号:201108101015);广东医学院基金项目(编号:XG1001,JB1214,XZ1105,STIF201122,M2011024,M2011010)资助
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生物学通路被广泛应用于基因功能学研究,但现有的生物学通路知识并不完善,仍需进一步扩充.生物信息学预测为通路扩充提供了一种有效且经济的途径.文章提出了一种融合蛋白质-蛋白质互作知识以及Gene Ontology（GO）数据库信息进行基因通路预测的新方法.首先选取目标基因在蛋白质-蛋白质互作层面上的邻居所在的Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）通路为候选通路,然后通过检验候选通路中的基因是否在与目标基因关联的GO节点富集来判断目标基因的通路归属.分别利用H
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