目的监测分析2015-2016年南京地区儿童腹泻主要病原体,为该地区儿童腹泻病原的快速诊断与防治提供依据。方法收集2015-2016年在南京市儿童医院感染消化科就诊的典型腹泻患儿粪便标本(或肛拭子) 300例,对易导致儿童腹泻的最常见的8种病原菌(沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、5种肠致泻性大肠埃希菌)进行病原菌分离、鉴定,同时采用荧光定量PCR方法对易导致儿童腹泻的5种肠道病毒(诺如病毒、札如病毒、轮状病毒、星状病毒、腺状病毒)进行检测分析。结果在300例腹泻患儿粪便标本中,病原菌的总检出率为17%,其中肠致泻性大肠埃希菌检出率为10%,志贺菌属检出率为0. 03%,沙门菌属检出率为6. 7%;副溶血性弧菌未检出;病毒总检出率为9%,其中诺如病毒检出率为4. 7%,札如病毒2. 3%,轮状病毒0. 33%,星状病毒0. 33%,腺状病毒1. 33%。2015和2016年间病原体总检出率、病原菌检出率、病毒检出率差异无统计学意义(P>0. 05)。结论 2015-2016年南京地区引起儿童腹泻的主要肠道病原菌以致腹泻型大肠杆菌属为主;其次为沙门菌属,肠道病毒以诺如病毒为主,其次为札如病毒。