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小土尔根铜矿位于诺尔特盆地,赋存于花岗闪长斑岩与红山嘴组凝灰质砂岩、凝灰质粉砂岩的内接触带附近,矿体呈脉状,受节理及裂隙控制。矿化主要为浸染状、细脉状、细脉-浸染状、网脉状,围岩蚀变具硅化、钾化(钾长石、黑云母)、黄铁矿化、绢云母化、高岭石化、绿泥石化、绿帘石化、碳酸盐化。通过野外地质调查、岩心观察、镜下鉴定和对比研究,认为小土尔根为斑岩型铜矿。