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采用高压匀浆处理以及超声波处理均可明显地减小菌丝体的长度，利于菌丝体内有效成分的提出。木瓜蛋白酶和鸡蛋清溶菌酶对菌丝体的溶菌效果不很理想，而纤维素酶的溶菌效果显著。在高压匀浆或超声波处理的基础上，结合纤维素酶的作用，可收到良好的破壁溶菌效果，其中以40 MPa的压力进行高压匀浆后，再以0.15%的纤维素酶在pH4.5，50℃作用2h的效果最好，而且处理起来较为方便，可使培养液中分离出的菌丝体固形物含量下降50%，培养液中虫草菌主要有效成分增加55%。培养液经过滤或离心处理后可达到完全澄清的状态。