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长吻鮠的肾脏由肾小体、肾小管、集合管及拟淋巴组织等构成.肾小体在肾前段最多(2.2个/mm2),中段次之(约1.7个/mm2),后段最少(约1个/mm2);拟淋巴组织在肾的中后段逐渐增多;肾小球直径较小,在60~78μm之间;膀胱体积远比一般真骨鱼类大,移行上皮中有大型分泌细胞,最大径达100μm.纵肌和环肌同等发达,厚280~700μm.