茶苗嫩根cDNA文库的构建和EST分析

来源 :南京农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anysion888
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以茶苗嫩根为材料,采用SMART技术构建了cDNA文库并对其质量进行了鉴定。结果显示,该文库的重组率为92%,库容量为5×10^5,平均插入片段长度超过1kb,是一个较高质量的文库。从文库中随机挑取克隆并从5’端单向测定2651个克隆,获得2600个有效的EST(expressed sequence tag),序列的平均长度为703bp,用Phrap软件进行拼接,结果获得404个contigs、610个singlets。通过与NCBI的非冗余核酸数据库进行Blastx比对,初步确定已知功能基因7
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