【摘 要】
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目的:探究溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)与克罗恩病(Crohn’s disease,CD)两种肠道炎症疾病的发病机制,为临床治疗时的给药选择提供参考.方法:收集UC肠上皮细胞,CD肠
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目的:探究溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)与克罗恩病(Crohn’s disease,CD)两种肠道炎症疾病的发病机制,为临床治疗时的给药选择提供参考.方法:收集UC肠上皮细胞,CD肠上皮细胞,正常人肠上皮细胞,将他们进行基因芯片分析,从而拿到各自的基因表达谱.通过线形回归模型软件包limma对不同组的芯片进行差异比较,从而得到不同处理间的差异表达基因.利用数据库Gene Otology对基因功能定位的分类,通过cluster Profiler包进行GO聚类富集,将这些差异表达的基因从细胞内组成、分子功能和生物进程三方面上进行聚类,从而得到这些差异表达的基因对细胞的影响.利用DAVID网站对差异表达的基因进行KEGG PATHWAY的聚类分析,从而得到前UC与CD细胞发生改变的信号通路的异同之处.结果:通过差异分析,得到了UC、CD和正常细胞差异表达基因比较.GO结果显示UC和CD两种疾病确实存在着显著的差异,KEGG通路分析UC与CD细胞通路的一个重要区别在于信号传导方面,包括Cell adhesion molecules(CAMs)、ECM-receptor interaction、B cell receptor signaling pathway和Cytokine-cytokine receptor interaction.结论:两种疾病存在着上千个差异表达基因.其次,这两种疾病的细胞表现存在明显差异.最后,细胞内通路也存在差异,尤其是代谢上存在差异,因而可以通过代谢产物对这两种疾病以示区分.UC和CD这些分子水平上的差异,为临床上对这两种疾病的确诊提供了很好的思路.
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