【摘 要】
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【目的】对银耳进行转录组测序分析,分析多糖生物合成途径和挖掘关键功能基因。【方法】采用Illumina Hiseq 2500测序平台对银耳菌丝体进行测序,组装得到unigene序列,并与公
【机 构】
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四川省农业科学院分析测试中心,成都大学医学院,巴中市通江银耳科学技术研究所,四川省农业科学院
【基金项目】
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四川省财政创新能力提升工程专项资金项目(2013G XJS-014).
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【目的】对银耳进行转录组测序分析,分析多糖生物合成途径和挖掘关键功能基因。【方法】采用Illumina Hiseq 2500测序平台对银耳菌丝体进行测序,组装得到unigene序列,并与公共数据库进行对比分析和注释,挖掘果糖和甘露糖代谢通路相关基因。【结果】本研究共得到4.72 Gb raw data,拼接后获得17 008条unigene序列,N50为2073 bp;注释结果表明,76.47 %序列能够注释到Uniprot公共数据库,注释到GO分类和KEGG通路的unigene分别为10 152和567
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