【摘 要】
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为获得高质量南美白对虾肠道微生物宏基因组模板,采用传统CTAB法、试剂盒和仪器法提取南美白对虾(Penaeus Vanmamei,P.vannamei)肠道微生物宏基因组,通过琼脂糖凝胶电泳、紫
【机 构】
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广东省水产品加工与安全重点实验室广东海洋大学食品科技学院,广东医学院生物化学与分子生物学教研室
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为获得高质量南美白对虾肠道微生物宏基因组模板,采用传统CTAB法、试剂盒和仪器法提取南美白对虾(Penaeus Vanmamei,P.vannamei)肠道微生物宏基因组,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法和V3区16S rDNA扩增检测所得基因组的完整性、得率、纯度和目的片段质量。结果表明3种方法提取得到的DNA结构均较完整,但得率和纯度差别较大,传统CTAB法提取的DNA得率和纯度均试剂盒和仪器法高,试剂盒和仪器法受糖和盐类污染较高,3种方法提取的宏基因组均可特异扩增出V3区保守片段。综合比较得知传统CTAB法提取P.Vanmamei肠道微生物基因组在完整性、得率和纯度方面优于其他两种方法,可为后续分子生物学分析提供良好基因组模板。
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