嗜碱盐单胞菌X3中异化型硝酸盐还原酶编码基因簇的功能验证及蛋白结构预测

来源 :中国海洋大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：shen648491077

【摘要】

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细菌的氮代谢推动环境的氮循环,硝酸盐还原反应是氮代谢途径中重要步骤之一。本文运用酶活测定、qRT-PCR和生物信息学软件分析的方法,对嗜碱盐单胞菌(Halomonas alkaliphila)

【作者】

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王越李秋芬张艳

【机构】

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上海海洋大学水产与生命学院,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所

【出处】

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中国海洋大学学报:自然科学版

【发表日期】

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2019年4期

【关键词】

：

嗜碱盐单胞菌异化型硝酸盐还原酶基因簇narGYJV 3D结构 qRT-PCR 系统发育树 Halomonas alkaliphiladissimilator

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(31170113),水科院基本科研业务费项目(2017HY-ZD0502,2017HY-ZD1003),海洋公益性行业科研专项(201305043)资助.

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细菌的氮代谢推动环境的氮循环,硝酸盐还原反应是氮代谢途径中重要步骤之一。本文运用酶活测定、qRT-PCR和生物信息学软件分析的方法,对嗜碱盐单胞菌(Halomonas alkaliphila)X3中编码细菌异化型硝酸盐还原酶(Dissimilatory nitrate reductase,Nar)不同亚基的基因簇narGYJV进行了功能验证、蛋白结构预测和系统发育分析。研究表明,X3菌株中存在narGYJV基因簇并具有表达活性,测得Nar的酶活为每克蛋白21.415 U;预测到的narGYJV编码蛋白功能

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