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目的研究先天性巨结肠术后小肠结肠炎的危险因素。方法选取2013年1月~2017年12月在我院行手术治疗的先天性巨结肠患者140例,按照术后是否并发小肠炎分为观察组(46例)和对照组(94例)。观察组为术后并发小肠结肠炎,对照组为未并发小肠结肠炎。探讨相关危险因素。结果术前患有肠炎、上呼吸道或肺部感染、营养不良以及术后吻合口瘘或狭窄、肠梗阻等并发症情况、切除直肠黏膜及内括约肌为先天性巨结肠术后小肠结肠炎患者的单因素;多因素为术前患有肠炎、患有上呼吸道或肺部感染、营养不良。两组的年龄、手术时年龄、病变类型、手术方式、手术切除范围比较,差异无统计学意义(P<0.05)。结论先天性巨结肠术后出现小肠结肠炎的危险因素包括术前患病情况、营养状况、术后并发症发生情况,切除直肠黏膜及内括约肌是避免术后并发小肠结肠炎的有效措施。