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利用已经公布的核盘菌基因组测序结果,对已有的核盘菌基因组中SSR的类型、大小及分布等数据进行统计分析。在核盘菌基因组内发现1 693个SSR序列,其中出现频率最高的为6碱基和4碱基的SSR序列,分别达到577次和449次,1碱基、3碱基和5碱基的SSR则分别出现97、180、57次。其中有340个SSR序列出现在308个基因内。大多数基因（284个基因）都只含有1个SSR,占含SSR基因总数的92.21%;17个基因中含有2个SSR,6个基因中含有3个SSR,含4个SSR的基因只有1个。在基因序列内,出现