【摘 要】
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通过对3头18月龄安格斯牛下丘脑-垂体-卵巢组织进行转录组测序和生物信息学比较分析,筛选和挖掘与肉牛繁殖活动相关候选基因和信号通路.通过转录组测序,进行表达基因分析、GO
【机 构】
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湖南畜牧兽医研究所,湖南长沙410130
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通过对3头18月龄安格斯牛下丘脑-垂体-卵巢组织进行转录组测序和生物信息学比较分析,筛选和挖掘与肉牛繁殖活动相关候选基因和信号通路.通过转录组测序,进行表达基因分析、GO和KEGG富集分析以及信号通路筛选.结果显示,共获得61.92 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到6.88 Gb,Q30碱基百分比在92.42％及以上.有15 154个基因在所有组织中都有表达,有4 780个基因只在2种组织器官中共同表达,有5 809个基因只在其中的一个组织器官中表达.下丘脑-垂体-卵巢各组织所表达的基因中,在GO数据库得到注释的分别为2 168,2 101,13 777个,在KEGG数据库中得到注释分别有12 477,12 446,12 176个.在所有KEGG通路中,Notch信号通路(notch signaling pathway)、神经营养因子信号通路(neurotrophin signaling pathway)和血管内皮生长因子信号通路(VEGF signaling pathway)的表达频率最高,说明这些信号通路可能也参与下丘脑-垂体-卵巢轴对母牛繁殖活动的调节.
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