2006年通过对密云水库与其上游主要河流——潮河、白河、清水河入库河段水质的监测和分析,结果表明:密云水库与其河流入库河段的pH值全年平均值差异很小,并表现出汛期最低,冬季较低,其它季节相对较高的时间变化特征。密云水库的总氮、硝态氮含量全年几乎都低于三条河流,其中潮河的总氮、硝态氮含量最高,其次是白河,最低的是清水河;三条河流入库河段的总氮和硝态氮含量变化特征为植物生长季较低,非生长季较高。密云水库全年总磷含量均值低于潮河和白河而高于清水河,潮河和白河总磷含量最高值出现在7月份的洪水期。密云水库的COD高于潮河、白河和清水河,三条河流中清水河的COD最高,这与清水河流域引流养鱼向河道直接排放含有机物质的废水有关;水库及其主要河流入库河段的COD最高值出现在7-9月,最低值出现在1月和12月。