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果实在园艺产品的种类和构成中占有主要地位，果实品质研究在诸多园艺作物的品质研究中最具有代表性和实际价值。本项目以我国栽培面积和产量居世界首位的柑橘、苹果和番茄等园艺作物果实为着眼点，以果实色泽、风味和营养成分等性状为关键点，综合应用分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究手段，从果实品质的形成机理、品质的保持与调控机制以及优异种质发掘与创制等三个相互关联的层面（构成三个科学问题）进行系统的研究，以期解析果实品质形成与调控途径的复杂网络及交互作用，明确品质形成的关键步骤，发掘品质形成关键调控因子，阐明果实品质形成、积累与保持过程的遗传与生理本质，提供品质改良的技术支持和基础材料，培育适合不同市场需求的品种，促进产业可持续发展。